孔径通常由使用目的来决定。支原体可以用0.1μm孔过滤器去除。大多数培养基、缓冲溶液、常规实验室除菌通常采用0.22μm孔过滤器完成。溶液的澄清和预过滤最好用0.45μm的过滤膜操作。0.22um水性溶液的除菌和超净处理、溶剂的超净处理（HPLC）0.45um水性溶液的澄清、溶剂的澄清（HPLC）过滤器装置必须和样品的化学性质完全相容。过滤膜含有可能对一些应用造成干扰的润湿剂。一些滤膜可能结合蛋白质或其它大分子，而导致过滤器堵塞或样品的损失。因此，了解样品性质以是非常重要的。聚醚砜(PES):用于过滤细胞培养基。PES结合蛋白质的能力和可提取物含量都非常低。流速也高于纤维素或尼龙膜。#醋酸纤维素酯膜(CA):滤膜对多数大分子的亲和力非常低，尤其适用于要求低蛋白结合作用的实验，如含血清培养基的过滤。#尼龙膜(聚酰胺NYLON):本质上是亲水性的，推荐用于对可提取物含量要求非常低的应用，因为它们不含任何润湿剂、清洁剂或表面活性剂。尼龙膜的耐化学性能较强，适于过滤腐蚀性较大的溶液，如酒精和DMSO。#特氟龙®（PEFE，聚四氟乙烯）:膜是疏水性的，适于过滤气体。特氟龙膜的耐化学性极佳，这使其非常适于过滤其它滤膜不能过滤的溶剂或其它腐蚀性化学品。由于其疏水性，特氟龙膜在过滤水性溶液以前必须用溶剂（乙醇）预先润湿。
#过滤膜直径50mm 有效过滤面积19.6cm2，预计通量150-750ml#过滤膜直径70mm 有效过滤面积39.5cm2，预计通量500-2500ml#过滤膜直径91mm 有效过滤面积65cm2，预计通量1000-5000ml
1.离心去除大部分悬浮颗粒改善流速和吞吐量。也可以预过滤减少颗粒负荷和过早的膜堵塞。2.对于大多数应用，在室温下过滤溶液没有问题。通常增加溶液的温度会增加流速。如将细胞培养基的温度从4℃增加至37℃会使流速加倍。这是由于培养基粘度的下降。3.对于真空过滤，建议采用400mm Hg(7.73 psig)的压差（真空）。再增加压差只会使流速提高一点，但是可能导致过量泡沫的形成，因为滤出液中的气体会从溶液中逸出产生气泡。
